根据《中华人民共和国政府采购法》等有关规定及我所科研需要，现对四川省农业科学院生物技术核技术研究所280份玉米基因组重测序项目进行公开比选，欢迎符合条件的供应商参加比选。

一、项目名称：280份玉米基因组重测序

二、项目编号：SAAS-SHS-20250603

三、项目内容及要求

1、项目预算：12万元。报价应包含本次项目一切含税费用。

2、项目概况：因科研工作需要，拟开展280份玉米基因组重测序项目，现需要供应商根据我们实际需求提供服务，欢迎有资质和有能力的供应商前来参与投标。

3、 技术目标：

（1）供应商负责所有样本的DNA提取；

（2）基于二代高通量测序平台完成测序工作并对测序数据进行质控及分析，每个样本测序数据量：25G；

（3）质控参数：Q20>90%&Q30>85%（每个样本的测序数据量不少于承诺平均数据量的98%）；

（4）SNP过滤条件: QD < 2.0 || MQ < 20.0 || FS > 60.0 || QUAL < 50 || MQRankSum < −12.5 || ReadPosRankSum < −8.0|| DP < 5；

（5）InDel过滤条件为：QD < 2.0 || FS > 200.0 || ReadPosRankSum < -20.0 || SOR > 10；

（6）过滤掉 missing rate >80%，frequency of heterozygous genotype >5%的位点；

（7）对每个材料的bam文件进行统计分析，统计结果包括Mean Mapping Quality、Number of Mapped Reads(Percent)、Whole Genome Coverage Rate、GC Percentage、Mean Coverage、Median Insert Size等（推荐软件qualimap）。

4、 结果交付：

所有样本的原始数据，遗传变异分析结果，遗传变异分析中间文件G.VCF。分析内容包括：①数据质控：去除接头污染和低质量数据；②与玉米V5.0参考基因组比对；③SNP及Indel检测及注释结果；④bam文件统计分析结果。

5、 项目周期及相关要求：测序周期60个工作日；基因组组装和注释60个工作日。

四、比选申请人的资格要求

（1） 投标人应为中华人民共和国境内注册的企业法人或其他组织，具有独立承担民事责任的能力；

（2） 具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；

（3） 具有履行合同所必须的设备和专业技术能力；

（4） 具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；

（5） 参加本次比选活动前三年内，在经营活动中没有重大违法记录；

（6） 法律、行政法规规定的其他条件：参加本项目比选活动的比选申请人及其现任法定代表人、主要负责人前3年内不得具有行贿犯罪记录；

（7） 本项目不接受联合体投标，不接受转包和分包。

五、投标文件

1、报名文件

（1）单位营业执照复印件（盖鲜章）；

（2）单位资质证明材料复印件（盖鲜章）；

（3）委托代理人身份证复印件（盖鲜章）；

（4）委托代理人授权委托书（含联系方式）或单位介绍信（盖鲜章）。

（5）单位介绍（盖鲜章）。

2、比选文件

比选文件包括分为技术部分、报价部分和商务部分。

（1）技术部分：针对本项目的完整技术解决方案；针对本项目的详细实施计划；项目质量的保障措施；后期服务承诺表。

（2）报价部分：投标人所投报价应包含完成项目所需的一切费用。如有遗漏，中标人应无偿自行免费补齐，招标人将不再另行支付此项费用。各投标人应按招标文件中技术服务表格式报出各分项单价、总价和投标总价。

（3）商务部分：投标方负责人有效身份证、单位介绍信或授权委托书（加盖鲜章）；注册于中华人民共和国的企业法人营业执照副本复印件（加盖鲜章）；资质证书副本复印件（加盖鲜章）。

以上资料需装订成册，一式两份加盖鲜章，文件袋密封且加盖密封条，文件袋封面备注“公司名称+项目名称+联系人+联系电话”。提交时间为资格审查通过后至比选会议举行前。

3、报名方式

报名资料快递到报名地址或直接交到报名地点。

4、报名截止时间

报名截止时间为2025年06月16日17:00。快递以到件时间为准。

5、报名联系地址及联系方式

（1） 地址：成都市锦江区静缘路66号，四川省农业科学院生物技术核技术研究所1号楼科技管理办公室。

（2） 报名联系人：张老师；联系电话：028-84504609；电子邮箱43169881@qq.com

（3） 技术咨询：聂老师，15928970129

六、其他说明

公告期结束后，由我单位工作人员电话通知后续安排。如有2家及以上供应商报名，以会议评比方式确定供应商；如仅有1家供应商报名，以协商方式确定合同内容。