根据《中华人民共和国政府采购法》等有关规定及我所科研需要，现对四川省农业科学院生物技术核技术研究所小麦籽粒灌浆期多组学联合分析项目进行公开比选，欢迎符合条件的供应商参加比选。
一、项目名称：小麦籽粒灌浆期多组学联合分析
二、项目编号：SAAS-SHS-20250906
三、项目内容及要求
1、项目预算：20万元。报价应包含本次项目一切含税费用。
2、项目概况：因科研工作需要，拟开展5份小麦共计90个灌浆期籽粒样本的转录组、蛋白组及代谢组等多组学联合分析项目。现需要供应商根据我们实际需求提供服务，欢迎有关供应商前来参与比选。
3、技术要求：
(1) 转录组学
① 建库方式要求：普通转录组文库。
② 测序平台要求：Illumina NovaSeq PE150。
③ 质控要求：Q20＞90% & Q30＞85%，GC分布正常、
④ 测序数据量要求：每个样本有效数据量≥12 G rawdata。
⑤ 生信分析要求（包括但不限于）：数据质控：对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads的处理、数据产出统计及测序数据的成分和质量评估；参考基因组比对分析；基因表达水平分析：样本间基因表达水平的相关性分析、主成分分析、基因差异表达分析；差异表达基因中转录因子鉴定；差异基因富集分析：GO、KEGG富集分析；差异表达基因的蛋白质互作网络分析；GSEA分析等。
(2) Astral-DIA蛋白质组学
① 蛋白提取质控要求：每个样本提取蛋白总量不低于10μg，且浓度不低于1μg/μl；
② 质谱仪器平台要求：Astral平台（扫描速度：up to 200 Hz，质量准确度：RMS< 5 ppm；灵敏度：Single ion detection）；
③ 液相色谱仪满足：最大压力1500bar (21,750psi)，流速范围1nL/min - 100µL/min，增幅为1nL，色谱柱温度范围高于环境温度5℃至80℃；
④ 仪器运行时间要求：单个样品上机时间10 - 30min；
⑤ 生信分析要求（包括但不限于）：数据质控：DIA质控报告、鉴定总览统计表格；蛋白功能注释：功能注释结果Venn图、亚细胞定位分析、GO功能注释分析、COG功能注释分析、KEGG功能注释分析、转录因子分析等；定量分析：定量统计结果、PCA分析、重复性分析；差异蛋白筛选和分析：火山图、差异蛋白浓度注释分析、聚类分析、富集分析（GO、KEGG、亚细胞定位）、GSEA分析、互作分析等；DIA质控：肽段长度分布、unique肽段数分布等。
(3) 植物广靶代谢组
① 仪器平台要求：SCIEX QTRAP®6500+质谱仪，需采用多反应监测（MRM）扫描模式对化合物进行定量；
② 数据质控要求：检测过程中样本间需增添标准品混标样本与试验样本间穿插的空白样本进行数据质控分析；
③ 生信分析要求（包括但不限于）：代谢物定性定量分析；代谢物检测数据质控；代谢物通路及分类注释：KEGG功能注释、HMBD分类注释及LIPID MAPS分类注释等；差异代谢物筛选：PCA分析，PLS-DA分析、差异代谢物分析（Venn图、火山图、热图及火柴杆图等）；差异代谢物聚类分析：分组差异代谢物聚类分析、差异代谢物K-Means分析、Z-score分析、KEGG富集分析（富集气泡图、富集通路图）、GSEA分析、差异代谢物ROC曲线分析等。
4、结果交付：质谱分析参数及鉴定结果；下机原始数据、质控数据及生信分析结果等。
5、项目周期及相关要求：检测周期30个工作日；生信分析60个工作日。
6、商务要求：
(1) 售后技术支持：供应商需具有充足的项目经验和专业技术人员，有能力保证本项目的顺利开展，提供7×24小时免费电话咨询服务，当样品选择、数据解读等方面出现存疑，在收到相关邮件或电话后于24小时以内予以回应，遇到复杂的问题，3天内提出解决方案（特殊情况和不可抗拒因素除外）。
(2) 供应商需配备项目团队，团队成员均具备相关工作经验且管理与实施需分工明确。
(3) 供应商应发表过相关项目文章。
(4) 数据储存时间：≥3个自然月。
(5) 其他：未经比选人同意，成交申请人不得将完成相关检测后剩余的样本移交第三方机构或用于危害国家安全事宜。测序数据知识产权为比选人独有，未经比选人同意，成交申请人不得私自公开或使用。
四、比选申请人的资格要求
1、 比选申请人应为中华人民共和国境内注册的企业法人或其他组织，具有独立承担民事责任的能力；
2、 具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；
3、 具有履行合同所必须的设备和专业技术能力；
4、 具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；
5、 参加本次比选活动前三年内，在经营活动中没有重大违法记录；
6、 法律、行政法规规定的其他条件：参加本项目比选活动的比选申请人及其现任法定代表人、主要负责人前3年内不得具有行贿犯罪记录；
7、 本项目不接受联合体比选，不接受转包和分包。
五、投标文件
1、报名文件
(1) 单位营业执照复印件（盖鲜章）；
(2) 单位资质证明材料复印件（盖鲜章）；
(3) 委托代理人身份证复印件（盖鲜章）；
(4) 委托代理人授权委托书（含联系方式）或单位介绍信（盖鲜章）。
(5) 单位介绍（盖鲜章）。
报名资料快递到报名地址或直接交到报名地点。报名截止时间：2025年9月23日17:00。快递以到件时间为准。
2、比选申请文件
比选申请文件格式请参照附件。比选申请文件正副本可分别封装于不同的密封袋内，也可密封于同一密封袋内；密封袋上应注明“公司名称+项目名称+联系人+联系电话”。提交时间为资格审查通过后至比选会议举行前。
3、地址及联系方式
(1) 地址：成都市锦江区静缘路66号，四川省农业科学院生物技术核技术研究所1号楼科技管理办公室。
(2) 报名联系人：任老师；联系电话：028-84504609；电子邮箱2545881802@qq.com
(3) 技术咨询：杨老师，17313016148
六、其他说明
公告期结束后，由我单位工作人员电话通知后续安排。如有2家及以上供应商报名，以会议评比方式确定供应商；如仅有1家供应商报名，以协商方式确定合同内容。