巴中市农林科学研究院始设立于2017年11月，于2019年6月升格为市政府直属正县级事业单位，挂市农产品质量安全检测中心、市林产品质量安全监测站牌子，是四川省农业科学院（含四川省畜牧科学研究院）、四川省林业科学研究院分院。内设1室2科6所1中心（办公室，种质资源科、科技合作科，茶叶、经济林、道地药材、畜牧兽医水产、果蔬、农业生态与环境研究所，分析测试中心）。

全院现有职工40人（含编外辅助性人员及科研助理11人），其中：40岁及以下人员28人，硕士及以上学历21人，中高级职称专业技术人员18人，省先进工作者1人、省科技系统先进个人2人、市农业领军人才2人、市优秀青年人才3人、市决策咨询委员会委员4人。

办公实验楼1600 m2，建成农林产品质量安全检测室、茶叶加工与审评室、中药材炮制室、概略养分分析室，有各类科研仪器设备80余台（套）。在巴州区水宁寺镇、玉堂办事处、南江县贵民镇、通江县空山镇建成科研基地4个450亩，正在会同省院创建畜禽水产种业省级重点实验室。

实施省部级科研及推广项目20个，发表论文54篇，编制地方标准19项，授权发明专利7项、实用新型专利18项，获全国农牧渔业丰收二等奖1项、省科学技术进步奖二等奖3项、省科学技术进步奖三等奖1项。