四川省食用菌研究所是在四川省农业科学院农业资源与环境研究所微生物研究中心和食用菌研究中心（原土壤肥料研究所微生物研究室）基础上成立的县（处）级事业单位。从上世纪70年代末开始从事食用菌研究开发工作，经过几代科研人员的努力，已发展成为全国食用菌研究开发领域具有影响力的科研机构。

围绕产业发展需求，重点开展食药用菌种质资源发掘利用，优质丰产食用菌新品种选育，高效轻简栽培技术研究，工厂化智能化栽培技术研究，绿色安全贮运保鲜技术研究，食用菌精深产品加工产品开发，农业微生物种质资源发掘评价利用和长期定位观测等工作。

已建成3000余平方米实验室，配备有开展种质资源保藏、工厂化栽培、品种选育、菌种扩繁、功能成分挖掘、产品加工成套仪器设备，设备价值达到4000余万元，拥有食用菌工厂化栽培技术研究中试平台、食用菌液体菌种扩繁生产线、食用菌产品加工GMP车间等80余亩产业化示范基地。