四川省农业科学院农产品加工研究所于2009年11月经中共四川省委机构编制委员会办公室批复，由原实验场更名成立,并于2021年2月经中共四川省委机构编制委员会办公室批复挂牌成立四川省农业科学院食物与营养健康研究所,是西部地区省级农科院农产品加工科技创新联盟挂靠单位。单位下设职能管理部门、研究中心和四川省农业科学院基地管理机构（代管）等机构。

职能管理部门包括所党政办公室、科技管理办公室、科技产业中心、条件财务办公室、后勤服务中心；研究中心包括果蔬贮藏加工研究中心、保鲜与物流研究中心、发酵食品研究中心、粮油加工研究中心、功能食品研究中心；院基地管理机构（代管）包括新都基地管理中心、郫都基地管理中心和科普培训中心。全所现有在职职工69人，其中行政人员9人，专技人员42人，工勤人员18人。全所共有研究员5人，副研究员9人，博士研究生9人，硕士研究生19人。

本单位重点围绕川果、川菜、川粮油、川茶、川药和烘干冷链物流主要开展果蔬采后商品化处理、农产品烘干冷链物流、发酵食品加工、油菜加工和精炼、药食同源及营养健康产品开发和功效评价等加工技术研究及推广应用，相关设施设备研发、建设与应用管理等工作。现建有农产品贮藏加工、油脂加工、主食加工、发酵食品、预制菜等5个中试车间，四川省果蔬功能食品加工技术工程实验室、国家油菜工程技术研究中心成果转化示范基地、农业部国家薯类加工技术研发分中心、四川省农业科学院传统发酵食品创新研究开发中心、四川省农业科学院功能食品研究开发中心等5个科研平台。2020年发起成立西部地区省级农科院农产品加工科技创新联盟，2022年与四川省自然资源科学研究院共建“中国-新西兰猕猴桃‘一带一路’联合实验室采后贮藏加工中心”。近年来，先后承担及参与国家自然科学基金、国家科技支撑计划课题、省科技重大专项等项目580项，累计到位经费7700余万元；获2022年度全国农牧渔业丰收奖二等奖1项，获2019年神农中华农业科技奖一等奖1项，获2016年四川省科技进步一等奖1项，获2013、2017、2019年四川省科技进步三等奖3项；发表论文220余篇，SCI收录44篇，核心期刊128篇；授权专利80余项，其中国际发明专利2项，各类产品80余个；在科技成果转化和企业技术服务中发挥了重要作用。

院基地管理机构主要负责为农科院科研试验基地提供服务和保障、开展科普宣传等工作，详细介绍见院域网基地管理机构相关内容。

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