生物技术研究中心成立于1999年，前身是轻工酿酒研究室。现有研究人员6人，其中研究员2人，副研究员2人，初级技术人员2人；硕士研究生2人，四川省学术和技术带头人1人，四川省学术和技术带头人后备人选1人。

该中心主要从事微生物选育及利用、酿酒工艺、生物技术领域的研究。先后获部省级重大科技进步奖6项（二等奖3项，三等奖3项）、泸州市科技进步5项（一等奖1项，二等奖4项）。其中“高酶活浓香型曲药微生物的选育及利用研究”、“高粱酿酒品质分析及粳高粱酿造泸型酒配套工艺研究”和“广适性高酶活新型根霉菌C－24的选育与应用”三项成果分别获得四川省科技进步二等奖。成功选育的C－24根霉菌被誉为我国第三代小曲根霉菌，经10多个省、市(区)推广应用，产生社会经济效益47.149亿元。

该中心先后在《酿酒》、《酿酒科技》、《中国酿造》、《西南农业学报》、《西南农业大学学报》等省级以上中文核心刊物发表科研论文70余篇，其中有多篇论文被中国微生物学会等单位评为优秀论文。