四川省农业科学院生物技术核技术研究所，前身为1960年成立的四川省农业科学研究所生理遗传系，1983年更名为四川省农业科学院原子能农业应用研究所，1987年正式更名为四川省农业科学院生物技术核技术研究所。内设党政办公室、条件财务办公室、科技管理办公室3个管理机构，生物技术育种工程中心、知识产权与成果转化中心、植物生长调节剂研究中心、农用核技术研究应用中心、作物诱变育种研究中心、生物技术育种与资源研究中心6个研究中心。

主要从事生物育种、辐射诱变、航天诱变、农化技术等基础研究与科技创新；开展种质资源分子检测与生物信息分析，分子育种与新品种选育，辐射工艺与农化产品等技术攻关及标准研究；开展基因工程、射线辐射、规划咨询、科技培训、科普宣传、成果转化等技术服务，以及植物新品种、专利等知识产权转移转化。现有秸秆生物综合利用技术国家地方联合工程实验室、四川省农作物分子育种平台、四川省农作物航天诱变育种技术工程实验室共3个省部级创新平台。