绿色低碳农业与环境微生物研究中心成立于2024年2月，是四川省农业科学院农业资源与环境研究所新的研究中心，主要从事与微生物相关的绿色低碳农业。

该中心下设微生物与作物、微生物与土壤健康、微生物与环境治理、微生物与废弃物资源化利用和微生物肥料共5个研究方向，围绕绿色低碳和农业微生物，结合多组学技术，研究微生物在农业领域中影响和利用机制，研发微生物相关的绿色低碳技术和产品。