四川省畜牧科学研究院是国内一流的区域性畜牧科技创新中心和人才培养基地，主要在遗传育种、生物技术、饲料营养、疫病防控、健康养殖、生产系统等领域开展畜牧兽医新技术、新产品研究，培养畜牧兽医技术人才，推广现代畜牧业生产技术，为四川及西南地区现代畜牧业发展提供科技支撑。

全院设有养猪、家禽、养兔、草食家畜、饲料、生物技术、动物营养、兽医、兽药、畜牧经济与生产系统10个研究所，办公室、人事处、科技处、财务处、后勤中心5个行政管理部门；建有动物遗传育种四川省重点实验室、畜禽生物制品四川省重点实验室、博士后科研工作站等国家及省级创新平台23个；在省畜牧高科技园区、简阳、乐至和双流等地建有10个具现代化设施设备的科研基地；在全省20个市州规模养殖场建立专家服务站249家；创办2家科技型企业，形成了较为完善的科技创新、成果转化及科技服务平台。