四川省农业科学院水产研究所前身四川省宜宾鲟鱼人工繁殖放流站，1977年改扩建为四川省水产研究所，隶属四川省农业科学院。是四川省唯一一家以淡水渔业应用和开发研究为主的省级、公益性专业水产研究机构，全国唯一的川陕哲罗鲑保种单位，国审新品种长吻鮠“川江1号”主持单位和乌鳢“玉龙1号”参与单位。

现有“四川省农业科学院水产研究所”和“四川省水产研究所”两块牌子，所内建有“四川省岩原鲤良种场”，承担“农业农村部长江上游珍稀特有鱼类保护基地”、“长江流域水生生物资源监测四川站”和“长江上游鱼类资源与环境四川省野外科学观测研究站”工作。

现有在编职工72人，其中有国务院政府津贴专家5人、四川省学术和技术带头人2人、四川省有突出贡献的优秀专家4人、四川省学术和技术带头人后备人选5人、现代农业产业技术体系综合试验站站长2人、四川省淡水鱼创新团队岗位专家4人。